2005年5月，已經(jīng)步入政壇十多年的呂清海迎來人生中的最關(guān)鍵時(shí)刻。彼時(shí)，神馬集團(tuán)雖然作為河南的工業(yè)骨干企業(yè)，位居全國(guó)化纖行業(yè)前列，但最終卻因循規(guī)守舊的防御性經(jīng)營(yíng)理念，由全國(guó)企業(yè)500強(qiáng)排名中的前200位倒退到近600位，旗下十幾家子公司陷入虧損。

面對(duì)如此局面，仕途得意的呂清海再次成為這家有著17000多名員工的國(guó)有企業(yè)掌門人。直到4年后的2009年，被調(diào)至鄭州擔(dān)任河南省工業(yè)和信息化廳黨組書記、副廳長(zhǎng)。

任職神馬集團(tuán)期間，呂清海主導(dǎo)了下屬上市公司神馬股份的股權(quán)分置改革，并先后投資數(shù)百億元，上馬了讓人眼花繚亂的新項(xiàng)目。